Ninjalar genellikle görünmezliğin ve imkansız şeyleri yapabilen bilgeliğin ustaları olarak tasvir edilirler. Fiziksel güç, zihinsel keskinlik ve dövüş sanatları onların sınırsız potansiyelini gösterir. Genellikle samurayların düşmanları olarak gösterilirler. Kavgaların sık yaşandığı Japonya'da ninjalar ve samuraylar ortaya çıkmıştır. Her ikisi de aynı amaç için savaşır, fakat meseleye farklı yaklaşır ve farklı taktikler kullanırlar.
Ninjaların gizemli teknikleri
Ninjalar olarak bilinen casusların köken hikayesi karmaşık ve anlaşılması zordur. Ninjalar kendi içlerine kapandıkları ve bilgilerini ustadan öğrenciye büyük ölçüde sözlü olarak aktardıkları için son derece az yazılı kayıt vardır. Genellikle dağlardaki küçük topluluklarda yaşarlar ve casusluk, sızma ya da gerilla eylemlerinde aktif rol alırlardı.
Aldatma, hedef şaşırtma ve mistifikasyon ustaları olan ninjalar, özel hayatları ve düşmanlarının korkuları hakkında hikayelere ilham vermek için kendileri hakkındaki gizemi korumaktan hoşlanırlardı. Ninjalar dağ insanlarıdır, inançlarının peşinden giden savaşçılardır ve bir kast sistemi içinde yalnız yaşarlar. Aileler Taoist, Şintoist ya da Budist olsun, kendi standartlarına göre gelişmiştir. Çevreyi kolaçan eden ajanlar, gerilla taktikleri, istihbarat toplama ve aktarma, göz boyama becerileri ve özel büyüsel-dinsel inançların hepsi on birinci yüzyıla kadar uzanan ninjutsu dövüş sanatının ürünleridir.
Japon tarihi boyunca büyük başarılarıyla tanınan klanlar, ileri gelenler tarafından işe alınan casuslar ve suikastçılar, savaşçılar ve akrobatlar, stratejistler, silah ve patlayıcı uzmanları, illüzyonistler ve büyücülerden oluşuyordu. Iga ve Koga klanları 12. ve 15. yüzyıllar arasında son derece etkiliydi ve daimyôlar ( eyalet yöneticileri) sık sık Hattori, Momchi ve Fujibayashi ninja ailelerini karanlık işler için kullandı. Güç mücadelesi yüzünden sürekli iç çatışmalar yaşanmıştır. Sengoku dönemi (1467-1568) tarihlerindeki en aktif dönemdi ve ninjalar bu çatışmalarda gizli ajanlar olarak çok önemli bir rol oynadılar.
On altıncı yüzyıldaki samuray savaşları Japonya'ya çok acı çektirdi. Bu çalkantılı dönemin sonuna doğru doğu takımadalarından Oda Nobunaga adında korkunç bir samuray ortaya çıktığında, ülke dört yüzyıldan fazla süren çatışmalardan ciddi şekilde zarar görmüştü. Kendisiyle aynı fikirde olmayan herkesi kovdu çünkü şogun pozisyonunu istiyordu. Ülkeyi fethetmek için ninjaları kullandıktan sonra, onların ölümcül oldukları ve istedikleri herkesi, hatta kendisini bile öldürebilecekleri sonucuna vardı.
1581 yılında 46,000 Nobunaga halkı Iga klanından 400 ninjaya karşı savaştı. Bir hafta süren savaşta yüzlerce kişi öldü ve görkemli gölge klanı tamamen yok oldu. Popüler inanışın aksine, ninja lideri Sandayz Momochi, tarihteki ilk iki ninja olan Shinetsu Hiko ve Otokashi ile aynı cesaret ve ustalıkla kendini güvene alarak Nobunaga'nın sürpriz saldırısından kurtuldu.
Ninjalar Japon kültürünün bir ürünüydü
İleri gelenlerin savaşa başvurmasını yasaklayan yeni bir yasa 1603 yılında yürürlüğe girerek, genellikle Savaşan Krallıklar olarak bilinen savaşan prenslikler döneminin sonunu işaret etti. O zamana kadar ulus içe doğru kapanmaya devam edecek ve zenginleşme varlığını sürdürecektir. Şogun Edo'yu (bugünkü Tokyo) başkent yaptığında nüfus patlaması yaşanmış ve şehir kısa sürede bir milyondan fazla insanın yaşadığı gerçek bir metropol haline gelmiştir. Bu refah çağında, para kazanma arzusu pek çok suçluyu ve katili cezbetmiştir.
Bu nedenle, şogunluk yeni tutuklama yöntemleri geliştirebilecek etkili bir polis gücüne ihtiyaç duyuyordu. Ardından ninjalara başvurdu ve birçoğu şehir polisine katılma teklifini kabul etti. Klanlar dağıldığında, birçok kişi suç hayatına yönelmekten başka çareleri olmadığını düşündü. Birçok samuray savaşın bir sonucu olarak kendilerini işsiz bulmuş ve dine ya da çiftçiliğe yönelmiştir (Ronin olarak adlandırılırlar).
1637'de Hristiyan köylülerin, Hristiyan bir daimyô'nun idam edilmesini sağladığı söylenen Tokugawa Şogunu Iemitsu'ya karşı ayaklanması sırasında ninjalar Hara Kalesi'nde son "resmi" müdahalelerini yaptılar. Birçok Romen samuray ve topraksız köylü ayaklanmaya katılarak birçok adanın kontrolünün ele geçirilmesine yardımcı oldu. Hristiyanlar, 200 bin Şogun savaşçısı tarafından takip edilirken Hara Kalesi'ne sığındı. Şogun'un ordusu isyancılardan sayıca üstündü, ancak ayaklanmayı durdurmak için yeterli değildi, bu yüzden ninjaları çağırdı.
Ninjutsu eskiden oldukça gizli tutulan bir sırdı, ancak günümüzde dünyanın her yerinde yaygın olarak öğretilmektedir. 1970'lerden beri çok sayıda yabancı okul açılmıştır. Japonya'da hala ninja yöntemlerini öğreten beş okul vardır, ancak yöntemleri gizemli bir havayı korusa da, modern dünyada çok az pratik kullanımları vardır.